在多数情况下，自动对焦无疑有着极大的好处，但在某些时候，使用手动对焦才是更明智的选择。在下面列举的一些情况下，自动对焦并不能总是很好地工作，此时就该把对焦键拨到M档，然后手动调节对焦坏。别忘了，切换手动对焦还可以起到对焦锁的作用，有时可以利用这一原理，先对某一物体对焦，然后再进行构图，只要拍摄相同距离上的物体，就不需要再对焦了。
1.杂乱的场景
当拍摄场景中充满成百上千个元素时——而且每一个元素都有大量细节——手动对焦就是必不可少的。特别是当被摄体比较小，或者不具有特定的形状、大小、色彩或明暗时。比如一簇鲜花，或挤满行人的街道等。
2.被摄体前有障碍物
如果被摄体位于某障碍物后方，而障碍物又位于对焦点附近，自动对焦就很容易把焦点对在障碍物而非被摄体上，此时手动对焦就可以大显身手了。如果你使用大光圈，那么还可以把障碍物虚化掉。例如拍摄笼子中的动物，窗户或门另一边的人等。
3.建筑物
很多建筑摄影师，特别是主攻当代建筑的，都喜欢用手动对焦。建筑物的几何形状和线条经常会迷惑相机自动对焦系统，比如很多摩天大楼。
4.高对比
当场景中有一大片对比强烈的明亮区域时，对自动对焦也是一个考验。例如在户外拍摄阴影下的人像，同时被摄体旁边有一大片强光区域的环境。
5.低反差
低反差场景对自动对焦系统来说是噩梦。低反差指被摄体和背景的颜色和色调比较接近，一个最常见的例子就是一片雪地中的白色雪人。
6.背景占大部分画面
相对被摄体来说较大的背景也会令自动对焦系统失效。例如一个矮小的人在巨大的城市街景前，自动对焦系统就无法工作了，切换手动对焦就可以做得又快又好。
7.夜景
当你想在漆黑的环境中拍摄时，你会发现手动对焦是你唯一的选择。比如拍摄星光的轨迹，或者进行光绘时。在这种情况下对焦需要大量尝试，可以使用变焦镜头的长焦端和LCD辅助对焦。